Existía una gran expectativa de que Paraguay retribuyera ese gesto con su presencia en el funeral. La principal crítica radica en que Santiago Peña priorizó una actividad privada en Estados Unidos, donde recibirá un premio de una ONG, en lugar de representar a Paraguay en el funeral al que asistirán 50 jefes de estado. Bachi Núñez intentó justificar la ausencia de Peña argumentando que el presidente ya tenía una agenda previa en Estados Unidos, una agenda que, evidentemente, no podía prever el fallecimiento del Papa.
Sin embargo, esta justificación es cuestionada por todos, se menciona que si bien no se puede predecir la muerte del Papa, sí se puede predecir cuál es la decisión más importante, considerando que un homenaje propio no se compara con la relevancia del fallecimiento de un Papa. Los legisladores que criticaron a Peña, también expresaron que debió priorizar asistir a los funerales del Papa Francisco, recordando el cariño del Papa por Paraguay y su conexión con el país.
